我看文献管理软件

在这个信息暴涨的时代,在庞大的数据库中寻找自己所需要资料已成为研究者每日必做的功课,而资料一旦脱离了数据库,下载到本地之后,管理检索就更见困难了。

之前我一直用Biblioscape管理目录,它分类清晰,支持中文,附件管理也很方便,有意思的是,作为一块美国公司的软件,它用一副中国传统山水画作为版权页面的LOGO。但是最近开始用Latex写论文,发现6.x版本不能导出BibTex格式,最新的7.0中已解决此问题,但汉字仍采用GB2312编码,不支持UTF-8,据说要等到8.0时才会支持,于是开始寻找替代品……

EndNote也有很多人使用,对Word支持较好,但不能导出BibTex,更新倒是很快,半年一个版本,但直到本月13日发行的的X1版才支持Biblioscape三年前就有的自建分类功能,它最吸引人的地方无非是支持众多期刊的引用格式输出,但是每个研究者能用到的不过其中屈指可数的几个,只要能导出BibTex,去期刊官方网站下个bst格式模版就可以随意转换了,从几百种没有听过的期刊名中翻检自己天天要用的那一个很爽么?Reference Manager曾经很有很有竞争力,但1999年被ISI收购并与EndNote合并之后,更新几乎停滞,至今还不支持中文;而创立于1980年的第三大管理软件Procite的下场更惨,被ISI收购之后就没有再更新过!

(详细的状况可以比较
耶鲁大学图书馆98年的横向评测
韦恩州立大学图书馆03年的评测
再看看Thomson公司现在官方的对比
这三个软件的境遇便不言而喻了。)

值得注意的是:它们在上世纪末先后被同一家公司收购——Thomson ISI!如果能整合各方资源集中力量做好一个软件也未尝不是好事,但竞争是软件前进的动力,竞争对手的缺乏使得EndNote开发速度大大放慢,而后两者一开始便注定要被牺牲,因为学术资本巨头想建立一套学术规范的工业标准,并不在乎这几个小软件有限的销售市场,因此并不在意用户的需求和反馈,它只希望这些行业主打软件都遵循它的标准支持它的数据库,一家独大之后便可漫天要价,但是事情并未朝他们所希望的方向发展:预印本站点,免费电子期刊,开源管理软件,乃至成为论文出版规范的LaTex,都在动摇它的地位。无可否认ISI Web of Knowledge有成熟的系统和无缝结合的检索工具,但它高盎的使用费用决定了它无法成为主流。现在连《Nature》和《Science》都已明确抵制微软Offcie2007的docx文档格式,Thompson旗下的软件也该考虑支持BibTeX了吧。好了,不扯那么远,对此问题有兴趣的可以自行查阅文献管理软件邮件组存档,我们继续讨论文献管理软件……

当下流行的国产软件NoteExpress(北京爱琴海公司)倒是博取众长,后来居上,在中文文献检索方面稳坐龙头,学校也购买了图书馆版,但采用的是IP控制,需要在线验证IP才能正常使用,不适合笔记本移动办公。个人单机版的价格在100元左右。

商业软件挑不出来,目光转向开源社区。制作Scientific Workplace 的Mackichan公司出过一个用Pascal编写的BibDB,但最后的版本2.2是在1998年10月发布的,没用过98的我实在无法习惯那个古旧的功能界面;新的有结合数据库用Python编写的Bibus,需要连接本机的数据库,如果不是服务器,为此单独装个数据库管理起来很麻烦,我没有尝试;

倒是Java制作的JabRef与BibTex结合的很好,需要JRE运行环境,第一次运行时需要在 Options–>Preferences–>Entry preview 中将两种预览模式中开头处的font face=”arial”都改为宋体font face=”simsun”,或系统上的其他中文字体才能正常显示论文题录中的中文字符。如果要给论文分组,则可在View中选择Toggle groups interface ,此项默认是不打开的。基本可以满足我现在的需要。

本来是要只是想输几篇引用文献,结果折腾了一堆软件,我想我还是比较喜欢磨刀,希望真的能从此一劳永逸,当然,那是不可能的——这不,在EndNote Dot CN那里又看到FireFox浏览器有一款文献管理插件——Zotero,貌似也很不错……

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2007 年 8 月 21 日 16:11

[…] 模版通常包括:规定正文格式的.cls,规定参考文献格式的 .bst,模版宏包 .sty 以及示例、说明、帮助等辅助文档。 应用模版最简单的办法是将全部文件复制到工作目录,然后直接更改示例文件的相应区块:标题、作者、摘要、正文、致谢等;但是网上很多所谓模版将格式与正文混杂在一起,阅读修改都很吃力,真正的模版应该是模块化的,诸如格式规则之类的东西应该对用户透明,下面就是使用模版后用户真正需要编辑的文件框架(此模版不支持中文): documentclass{article} % 定义文件类型,内置论文式样为 article % 采用外部模版就用同目录下的cls文件名代替 usepackage{txfonts} % 支持数学公式 usepackage{graphicx} % 支持图片插入 usepackage{hyperref} % 调用“hyperref”宏包 % 为章节生成PDF书签,为引用文献生成交叉链接。 begin{document} title{Title} author{Author} maketitle % 生成标题 begin{abstract} Abstract end{abstract} % 如果此部分的输出效果没有在式样模版中定义, % 就直接从示例文件中复制相应区块好了:) section{Chapter} TEXT bibliography{bib文件名} % 指定所用的参考文献库,如有多个文件,则用半角逗号隔开 % bib文件可用JabRef 等文献管理软件编辑处理 % 也可从ADS等文献库直接导出(BibTEX格式) bibliographystyle{bst文件名} % 指定所用参考文件输出样式, % 可选参数(plain,unsrt,alpha,abbrev) end{document} % 参考文献的引用格式及效果通常会在bst文件开头说明 […]

菜鸟先说
2008 年 4 月 4 日 12:19

NoteExpress有个致命缺点:不支持自填数据资源,在线搜索的文章不能直接连接下载.

谢亚龙下课
2008 年 10 月 3 日 18:25

呵呵,NoteExpress 出 2.0 了。

其实NoteExpress 支持 BibTex 的,给大家一个详细的教程:
http://www.reflib.org/wiki/index.php/NE2_Starter_Writing_BibTeX

Specter
2011 年 9 月 16 日 12:26

求更新……